三樓→馬來西亞佛教總會三樓，面向佛左旁房間。
- 第一間房：
- 1970年至1994年為儲藏室
- 1995年至1997年為函授部及事務處
- 1998年至2002年為函授部。
- 第二間房：
- 1970年至2001年為佛總保留房間
- 2002年歸馬來西佛學院院長寮房。
- 第三間房：
- 1970年至1999年為佛總保留房間
- 2000年至2001年教師辦事處
- 2002年轉成院長室及院務處。
- 第四間房：
- 1970年至1994年為院長、教務任、函授、學務、教職員辦事處
- 1995至2001年為學務、教師及職員辦事處
- 2002年為事務處及職員辦事處。
- 第五間房：
- 1970年至1995年為圖書館
- 1996年至1997年為教務處
- 1998年教務處及事務處
- 1999年至2000年為教務處及學務處
- 2001年至2002年為教務處、會計室。
- 第六間房：
- 1970年至1995年為圖書館
- 1996年至1999年為院長室
- 2000年至2001年為院長室及院務處
- 2002年為電腦室及學務處。
- 第七間房：
- 1970年至1994年為高中班課室
- 1995年至2002年為圖書館。
- 第八間房：
- 1970年至1994年為進修班課室
- 1995年至2002年為資料中心視聽室。
- 第九間房：
- 1970年至1993年為庶務寮房
- 1994年至2002年為舍監辦事處及休息室。
- 第十間房：
- 1970年至2002年為學生大宿舍。
- 十一間房：
- 1970年至2002年為馬來西亞佛教總會會議廳。亦為寄宿部學生自習及禪修空間。
- 第十二間房：
- 1970年至1994年為初中班課室
- 1995年至2002年為電腦室。
馬來西亞佛教總會三樓，面向佛右旁房間。
- 第一間房：
- 馬來西亞佛教總會儲藏室。
- 第二、三間房：
- 馬來西亞佛教總會保留房間。
- 第四間房：
- 1970年至2001年為馬來西亞佛教總會保留房間
- 2002年為教師辦事處。
- 第五、六間房：
- 馬來西亞佛教總會房間。
- 第七、八、九間:
- 1970年至1995年為佛總房間
- 1996年至2002年為學生小宿舍。
- 第十間房：
- 佛總檳州宏法會儲藏室。
- 第十一、十二間：
- 1970年至2002年為學生小宿舍。
二樓→馬來西亞佛教總會二樓借用佛教義學課室。
從佛教總會禮堂後梯第二樓右旁的四間課室為初級及第一二年班級；右旁的四間課室分高中及進修班課室。
三樓大圖
二樓大圖
